Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rexo1Q7TT28 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms