Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kcnf1Q7TSH7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms