Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrc2bQ7TPM1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms