Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp397Q7TNK4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms