Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nphp3Q7TNH6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms