Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TwistnbQ78WZ7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms