Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snd1Q78PY7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms