Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Ubfd1Q78JW9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ubfd1Q78JW9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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