Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cspg5Q71M36 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cspg5Q71M36 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cspg5Q71M36 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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