Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp34Q6ZQ93 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Usp34Q6ZQ93 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp34Q6ZQ93 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Usp34Q6ZQ93 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp34Q6ZQ93 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Usp34Q6ZQ93 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Usp34Q6ZQ93 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp34Q6ZQ93 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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