Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms