Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp8b3Q6UQ17 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms