Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tmeff1Q6PFE7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tmeff1Q6PFE7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tmeff1Q6PFE7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tmeff1Q6PFE7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tmeff1Q6PFE7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tmeff1Q6PFE7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms