Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prrt3Q6PE13 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms