Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SvoplQ6PDF3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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