Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Bhlhb9Q6PB60 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhb9Q6PB60 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhb9Q6PB60 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhb9Q6PB60 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhb9Q6PB60 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhb9Q6PB60 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhb9Q6PB60 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhb9Q6PB60 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhb9Q6PB60 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Bhlhb9Q6PB60 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms