Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Herc4Q6PAV2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms