Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhod1Q6P9Q4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhod1Q6P9Q4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fhod1Q6P9Q4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Fhod1Q6P9Q4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fhod1Q6P9Q4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms