Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HelbQ6NVF4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HelbQ6NVF4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms