Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cep78Q6IRU7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cep78Q6IRU7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms