Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atg9aQ68FE2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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