Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ino80dQ66JY2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ino80dQ66JY2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms