Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim24Q64127 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Trim24Q64127 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim24Q64127 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim24Q64127 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim24Q64127 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim24Q64127 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim24Q64127 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim24Q64127 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim24Q64127 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trim24Q64127 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim24Q64127 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim24Q64127 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim24Q64127 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trim24Q64127 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trim24Q64127 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim24Q64127 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim24Q64127 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Trim24Q64127 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim24Q64127 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trim24Q64127 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim24Q64127 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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