Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pan3Q640Q5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pan3Q640Q5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pan3Q640Q5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pan3Q640Q5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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