Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc18Q640L5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc18Q640L5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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