Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga3Q62470 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms