Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sp4Q62445 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms