Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Sprr1bQ62267 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms