Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prkd1Q62101 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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