Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BcanQ61361 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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BcanQ61361 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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BcanQ61361 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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BcanQ61361 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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BcanQ61361 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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BcanQ61361 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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BcanQ61361 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BcanQ61361 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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BcanQ61361 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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