Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cacna1eQ61290 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cacna1eQ61290 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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