Protein–RNA interactions for Protein: Q61079

Sim2, Single-minded homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim2Q61079 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sim2Q61079 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms