Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift20Q61025 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms