Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Klf3Q60980 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms