Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atf3Q60765 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atf3Q60765 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms