Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HnrnpdQ60668 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms