Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdrd5Q5VCS6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms