Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Uimc1Q5U5Q9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms