Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tsr1Q5SWD9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tsr1Q5SWD9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms