Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r195Q5SVD6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r195Q5SVD6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms