Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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