Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms