Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Xirp2Q4U4S6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Xirp2Q4U4S6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms