Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox3aQ4TU90 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms