Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Syne3Q4FZC9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syne3Q4FZC9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms