Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms