Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc110Q3V125 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc110Q3V125 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms