Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zmat1Q3V0C1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms