Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pfdn4Q3UWL8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pfdn4Q3UWL8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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