Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Capn13Q3UW68 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms